Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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C1orf61Q13536 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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C1orf61Q13536 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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C1orf61Q13536 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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C1orf61Q13536 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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C1orf61Q13536 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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C1orf61Q13536 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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C1orf61Q13536 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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C1orf61Q13536 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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C1orf61Q13536 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C1orf61Q13536 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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