Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms