Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF85Q03923 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms