Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRX1P78414 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRX1P78414 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRX1P78414 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRX1P78414 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRX1P78414 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRX1P78414 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRX1P78414 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRX1P78414 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRX1P78414 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRX1P78414 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRX1P78414 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRX1P78414 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRX1P78414 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IRX1P78414 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRX1P78414 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRX1P78414 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRX1P78414 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRX1P78414 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRX1P78414 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRX1P78414 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRX1P78414 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRX1P78414 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IRX1P78414 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRX1P78414 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRX1P78414 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRX1P78414 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRX1P78414 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRX1P78414 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRX1P78414 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRX1P78414 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRX1P78414 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRX1P78414 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRX1P78414 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRX1P78414 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRX1P78414 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRX1P78414 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRX1P78414 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRX1P78414 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRX1P78414 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRX1P78414 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRX1P78414 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRX1P78414 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRX1P78414 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRX1P78414 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
IRX1P78414 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRX1P78414 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRX1P78414 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRX1P78414 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRX1P78414 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRX1P78414 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRX1P78414 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRX1P78414 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRX1P78414 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRX1P78414 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRX1P78414 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRX1P78414 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRX1P78414 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRX1P78414 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRX1P78414 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRX1P78414 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRX1P78414 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRX1P78414 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRX1P78414 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRX1P78414 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRX1P78414 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRX1P78414 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRX1P78414 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRX1P78414 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRX1P78414 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRX1P78414 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRX1P78414 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRX1P78414 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRX1P78414 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRX1P78414 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRX1P78414 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRX1P78414 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRX1P78414 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRX1P78414 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRX1P78414 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRX1P78414 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRX1P78414 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRX1P78414 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRX1P78414 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRX1P78414 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRX1P78414 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRX1P78414 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRX1P78414 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRX1P78414 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRX1P78414 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRX1P78414 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
IRX1P78414 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRX1P78414 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRX1P78414 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRX1P78414 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRX1P78414 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRX1P78414 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRX1P78414 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRX1P78414 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRX1P78414 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms