Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UFM1P61960 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UFM1P61960 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UFM1P61960 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UFM1P61960 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UFM1P61960 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UFM1P61960 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UFM1P61960 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UFM1P61960 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UFM1P61960 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UFM1P61960 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UFM1P61960 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UFM1P61960 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UFM1P61960 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UFM1P61960 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UFM1P61960 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UFM1P61960 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UFM1P61960 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UFM1P61960 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UFM1P61960 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UFM1P61960 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UFM1P61960 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UFM1P61960 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UFM1P61960 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UFM1P61960 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UFM1P61960 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UFM1P61960 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UFM1P61960 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UFM1P61960 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
UFM1P61960 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
UFM1P61960 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
UFM1P61960 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
UFM1P61960 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UFM1P61960 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UFM1P61960 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UFM1P61960 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UFM1P61960 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UFM1P61960 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
UFM1P61960 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
UFM1P61960 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
UFM1P61960 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UFM1P61960 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UFM1P61960 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UFM1P61960 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UFM1P61960 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UFM1P61960 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UFM1P61960 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UFM1P61960 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UFM1P61960 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UFM1P61960 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UFM1P61960 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UFM1P61960 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UFM1P61960 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UFM1P61960 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UFM1P61960 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UFM1P61960 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UFM1P61960 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UFM1P61960 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UFM1P61960 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UFM1P61960 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UFM1P61960 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UFM1P61960 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
UFM1P61960 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UFM1P61960 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UFM1P61960 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UFM1P61960 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UFM1P61960 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UFM1P61960 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UFM1P61960 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UFM1P61960 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UFM1P61960 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UFM1P61960 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UFM1P61960 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UFM1P61960 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UFM1P61960 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UFM1P61960 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UFM1P61960 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
UFM1P61960 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
UFM1P61960 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UFM1P61960 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UFM1P61960 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UFM1P61960 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UFM1P61960 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UFM1P61960 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UFM1P61960 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UFM1P61960 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UFM1P61960 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UFM1P61960 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UFM1P61960 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UFM1P61960 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UFM1P61960 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UFM1P61960 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UFM1P61960 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UFM1P61960 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms