Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms