Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPTEP56180 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPTEP56180 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPTEP56180 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPTEP56180 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPTEP56180 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPTEP56180 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPTEP56180 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TPTEP56180 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPTEP56180 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPTEP56180 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPTEP56180 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPTEP56180 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPTEP56180 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPTEP56180 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPTEP56180 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPTEP56180 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPTEP56180 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPTEP56180 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPTEP56180 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPTEP56180 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TPTEP56180 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPTEP56180 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPTEP56180 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPTEP56180 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPTEP56180 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPTEP56180 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPTEP56180 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPTEP56180 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPTEP56180 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPTEP56180 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPTEP56180 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPTEP56180 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPTEP56180 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPTEP56180 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPTEP56180 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPTEP56180 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPTEP56180 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPTEP56180 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPTEP56180 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPTEP56180 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPTEP56180 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPTEP56180 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPTEP56180 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPTEP56180 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPTEP56180 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPTEP56180 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPTEP56180 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPTEP56180 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPTEP56180 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPTEP56180 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPTEP56180 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPTEP56180 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPTEP56180 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPTEP56180 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPTEP56180 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPTEP56180 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPTEP56180 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPTEP56180 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPTEP56180 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPTEP56180 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPTEP56180 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPTEP56180 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPTEP56180 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPTEP56180 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPTEP56180 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPTEP56180 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPTEP56180 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TPTEP56180 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPTEP56180 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPTEP56180 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPTEP56180 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPTEP56180 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPTEP56180 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPTEP56180 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPTEP56180 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPTEP56180 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTEP56180 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTEP56180 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTEP56180 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTEP56180 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTEP56180 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTEP56180 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTEP56180 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTEP56180 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTEP56180 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTEP56180 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTEP56180 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTEP56180 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTEP56180 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTEP56180 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTEP56180 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTEP56180 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTEP56180 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTEP56180 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTEP56180 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTEP56180 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTEP56180 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TPTEP56180 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TPTEP56180 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms