Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms