Protein–RNA interactions for Protein: P51911

CNN1, Calponin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN1P51911 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNN1P51911 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNN1P51911 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNN1P51911 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNN1P51911 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNN1P51911 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNN1P51911 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNN1P51911 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNN1P51911 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNN1P51911 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNN1P51911 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNN1P51911 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNN1P51911 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNN1P51911 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNN1P51911 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNN1P51911 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNN1P51911 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNN1P51911 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNN1P51911 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNN1P51911 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNN1P51911 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNN1P51911 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNN1P51911 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNN1P51911 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNN1P51911 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNN1P51911 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNN1P51911 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNN1P51911 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNN1P51911 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNN1P51911 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNN1P51911 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNN1P51911 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNN1P51911 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNN1P51911 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNN1P51911 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNN1P51911 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNN1P51911 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNN1P51911 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNN1P51911 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNN1P51911 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNN1P51911 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNN1P51911 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNN1P51911 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNN1P51911 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNN1P51911 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNN1P51911 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNN1P51911 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNN1P51911 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNN1P51911 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNN1P51911 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNN1P51911 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNN1P51911 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNN1P51911 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNN1P51911 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNN1P51911 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNN1P51911 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNN1P51911 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNN1P51911 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNN1P51911 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNN1P51911 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNN1P51911 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNN1P51911 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNN1P51911 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNN1P51911 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNN1P51911 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNN1P51911 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNN1P51911 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNN1P51911 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNN1P51911 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNN1P51911 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNN1P51911 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNN1P51911 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNN1P51911 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNN1P51911 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNN1P51911 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNN1P51911 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNN1P51911 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNN1P51911 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNN1P51911 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CNN1P51911 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNN1P51911 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNN1P51911 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNN1P51911 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNN1P51911 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNN1P51911 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNN1P51911 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNN1P51911 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CNN1P51911 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNN1P51911 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNN1P51911 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNN1P51911 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNN1P51911 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNN1P51911 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNN1P51911 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNN1P51911 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNN1P51911 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNN1P51911 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNN1P51911 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNN1P51911 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNN1P51911 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms