Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GATMP50440 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GATMP50440 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GATMP50440 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GATMP50440 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATMP50440 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATMP50440 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATMP50440 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATMP50440 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATMP50440 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATMP50440 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATMP50440 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATMP50440 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATMP50440 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATMP50440 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATMP50440 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATMP50440 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATMP50440 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATMP50440 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATMP50440 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATMP50440 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATMP50440 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATMP50440 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATMP50440 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATMP50440 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATMP50440 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATMP50440 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATMP50440 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATMP50440 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATMP50440 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATMP50440 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATMP50440 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATMP50440 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATMP50440 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATMP50440 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATMP50440 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATMP50440 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GATMP50440 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATMP50440 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATMP50440 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATMP50440 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATMP50440 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATMP50440 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATMP50440 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GATMP50440 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATMP50440 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATMP50440 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATMP50440 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATMP50440 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GATMP50440 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GATMP50440 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GATMP50440 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GATMP50440 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GATMP50440 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GATMP50440 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GATMP50440 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GATMP50440 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GATMP50440 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GATMP50440 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GATMP50440 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GATMP50440 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GATMP50440 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GATMP50440 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GATMP50440 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GATMP50440 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GATMP50440 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GATMP50440 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GATMP50440 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GATMP50440 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GATMP50440 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GATMP50440 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GATMP50440 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GATMP50440 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GATMP50440 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GATMP50440 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GATMP50440 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GATMP50440 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GATMP50440 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GATMP50440 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GATMP50440 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GATMP50440 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GATMP50440 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GATMP50440 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GATMP50440 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GATMP50440 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GATMP50440 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GATMP50440 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GATMP50440 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GATMP50440 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GATMP50440 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GATMP50440 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GATMP50440 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GATMP50440 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GATMP50440 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GATMP50440 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GATMP50440 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GATMP50440 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GATMP50440 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GATMP50440 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GATMP50440 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms