Protein–RNA interactions for Protein: P50416

CPT1A, Carnitine O-palmitoyltransferase 1, liver isoform, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPT1AP50416 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CPT1AP50416 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPT1AP50416 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPT1AP50416 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPT1AP50416 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms