Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX1P40424 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX1P40424 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX1P40424 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX1P40424 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX1P40424 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX1P40424 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX1P40424 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX1P40424 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX1P40424 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX1P40424 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX1P40424 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX1P40424 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PBX1P40424 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PBX1P40424 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PBX1P40424 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX1P40424 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX1P40424 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX1P40424 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX1P40424 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX1P40424 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX1P40424 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX1P40424 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX1P40424 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX1P40424 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX1P40424 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX1P40424 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX1P40424 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX1P40424 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX1P40424 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX1P40424 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX1P40424 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX1P40424 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX1P40424 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX1P40424 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX1P40424 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX1P40424 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX1P40424 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX1P40424 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX1P40424 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX1P40424 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX1P40424 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX1P40424 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX1P40424 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX1P40424 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX1P40424 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX1P40424 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX1P40424 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX1P40424 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX1P40424 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX1P40424 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX1P40424 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX1P40424 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX1P40424 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX1P40424 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX1P40424 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX1P40424 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX1P40424 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX1P40424 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX1P40424 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX1P40424 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX1P40424 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX1P40424 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX1P40424 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX1P40424 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX1P40424 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX1P40424 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX1P40424 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX1P40424 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX1P40424 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX1P40424 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX1P40424 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX1P40424 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX1P40424 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX1P40424 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX1P40424 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX1P40424 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX1P40424 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX1P40424 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX1P40424 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX1P40424 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX1P40424 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX1P40424 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX1P40424 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX1P40424 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX1P40424 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX1P40424 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX1P40424 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX1P40424 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX1P40424 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX1P40424 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX1P40424 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX1P40424 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX1P40424 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX1P40424 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX1P40424 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX1P40424 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX1P40424 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX1P40424 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX1P40424 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms