Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6V1E1P36543 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms