Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJC1P36383 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJC1P36383 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJC1P36383 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJC1P36383 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJC1P36383 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJC1P36383 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJC1P36383 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJC1P36383 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJC1P36383 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJC1P36383 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJC1P36383 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJC1P36383 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJC1P36383 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJC1P36383 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GJC1P36383 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GJC1P36383 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJC1P36383 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJC1P36383 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJC1P36383 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJC1P36383 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJC1P36383 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJC1P36383 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GJC1P36383 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJC1P36383 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJC1P36383 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJC1P36383 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJC1P36383 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJC1P36383 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJC1P36383 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJC1P36383 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJC1P36383 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJC1P36383 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJC1P36383 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJC1P36383 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJC1P36383 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJC1P36383 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJC1P36383 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJC1P36383 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJC1P36383 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJC1P36383 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJC1P36383 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJC1P36383 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GJC1P36383 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJC1P36383 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJC1P36383 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJC1P36383 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJC1P36383 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJC1P36383 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJC1P36383 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJC1P36383 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJC1P36383 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJC1P36383 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJC1P36383 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJC1P36383 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJC1P36383 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJC1P36383 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJC1P36383 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJC1P36383 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJC1P36383 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJC1P36383 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJC1P36383 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJC1P36383 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJC1P36383 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJC1P36383 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJC1P36383 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GJC1P36383 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJC1P36383 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJC1P36383 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJC1P36383 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJC1P36383 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GJC1P36383 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJC1P36383 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GJC1P36383 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJC1P36383 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GJC1P36383 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJC1P36383 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJC1P36383 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJC1P36383 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJC1P36383 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJC1P36383 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJC1P36383 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJC1P36383 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJC1P36383 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJC1P36383 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJC1P36383 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJC1P36383 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJC1P36383 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJC1P36383 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJC1P36383 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJC1P36383 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GJC1P36383 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJC1P36383 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJC1P36383 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJC1P36383 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJC1P36383 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJC1P36383 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJC1P36383 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJC1P36383 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJC1P36383 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms