Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP7BP35670 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms