Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB4AP04350 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB4AP04350 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms