Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA1P02647 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA1P02647 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA1P02647 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA1P02647 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA1P02647 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA1P02647 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA1P02647 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA1P02647 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA1P02647 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA1P02647 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA1P02647 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA1P02647 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA1P02647 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA1P02647 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA1P02647 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA1P02647 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA1P02647 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA1P02647 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA1P02647 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA1P02647 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA1P02647 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA1P02647 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA1P02647 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA1P02647 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA1P02647 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA1P02647 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA1P02647 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA1P02647 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA1P02647 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA1P02647 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA1P02647 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA1P02647 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA1P02647 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA1P02647 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA1P02647 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA1P02647 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA1P02647 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA1P02647 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA1P02647 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA1P02647 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA1P02647 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA1P02647 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA1P02647 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA1P02647 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA1P02647 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA1P02647 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA1P02647 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOA1P02647 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOA1P02647 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOA1P02647 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOA1P02647 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOA1P02647 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOA1P02647 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOA1P02647 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOA1P02647 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOA1P02647 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOA1P02647 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOA1P02647 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOA1P02647 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOA1P02647 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOA1P02647 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOA1P02647 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOA1P02647 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOA1P02647 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOA1P02647 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOA1P02647 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOA1P02647 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOA1P02647 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOA1P02647 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms