Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms