Protein–RNA interactions for Protein: O60841

EIF5B, Eukaryotic translation initiation factor 5B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF5BO60841 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF5BO60841 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF5BO60841 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF5BO60841 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF5BO60841 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF5BO60841 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF5BO60841 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF5BO60841 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF5BO60841 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF5BO60841 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF5BO60841 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF5BO60841 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF5BO60841 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF5BO60841 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF5BO60841 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF5BO60841 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF5BO60841 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF5BO60841 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF5BO60841 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF5BO60841 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF5BO60841 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF5BO60841 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF5BO60841 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF5BO60841 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF5BO60841 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF5BO60841 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF5BO60841 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms