Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEMFO60524 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEMFO60524 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEMFO60524 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEMFO60524 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEMFO60524 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEMFO60524 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEMFO60524 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEMFO60524 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEMFO60524 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEMFO60524 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEMFO60524 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEMFO60524 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEMFO60524 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEMFO60524 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NEMFO60524 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEMFO60524 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NEMFO60524 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEMFO60524 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEMFO60524 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEMFO60524 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEMFO60524 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEMFO60524 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEMFO60524 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEMFO60524 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEMFO60524 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEMFO60524 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEMFO60524 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEMFO60524 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEMFO60524 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEMFO60524 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEMFO60524 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEMFO60524 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEMFO60524 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEMFO60524 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEMFO60524 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEMFO60524 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEMFO60524 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEMFO60524 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEMFO60524 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEMFO60524 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEMFO60524 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEMFO60524 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NEMFO60524 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEMFO60524 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEMFO60524 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEMFO60524 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEMFO60524 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEMFO60524 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NEMFO60524 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NEMFO60524 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEMFO60524 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEMFO60524 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEMFO60524 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEMFO60524 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEMFO60524 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NEMFO60524 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEMFO60524 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NEMFO60524 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEMFO60524 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEMFO60524 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEMFO60524 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEMFO60524 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEMFO60524 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEMFO60524 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEMFO60524 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEMFO60524 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMFO60524 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMFO60524 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMFO60524 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMFO60524 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMFO60524 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMFO60524 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMFO60524 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMFO60524 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMFO60524 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMFO60524 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMFO60524 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMFO60524 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMFO60524 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMFO60524 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMFO60524 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMFO60524 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMFO60524 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMFO60524 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMFO60524 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMFO60524 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEMFO60524 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEMFO60524 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEMFO60524 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEMFO60524 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEMFO60524 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEMFO60524 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEMFO60524 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEMFO60524 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEMFO60524 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEMFO60524 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEMFO60524 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEMFO60524 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEMFO60524 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms