Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DENRO43583 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DENRO43583 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DENRO43583 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DENRO43583 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DENRO43583 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DENRO43583 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DENRO43583 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
DENRO43583 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DENRO43583 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DENRO43583 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DENRO43583 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DENRO43583 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DENRO43583 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DENRO43583 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DENRO43583 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DENRO43583 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DENRO43583 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DENRO43583 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DENRO43583 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DENRO43583 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DENRO43583 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DENRO43583 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DENRO43583 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DENRO43583 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DENRO43583 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DENRO43583 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DENRO43583 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DENRO43583 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DENRO43583 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DENRO43583 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DENRO43583 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DENRO43583 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DENRO43583 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DENRO43583 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DENRO43583 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DENRO43583 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DENRO43583 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DENRO43583 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DENRO43583 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DENRO43583 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DENRO43583 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DENRO43583 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DENRO43583 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DENRO43583 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DENRO43583 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DENRO43583 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DENRO43583 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DENRO43583 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DENRO43583 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DENRO43583 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DENRO43583 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DENRO43583 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DENRO43583 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DENRO43583 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DENRO43583 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DENRO43583 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DENRO43583 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DENRO43583 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DENRO43583 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DENRO43583 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DENRO43583 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DENRO43583 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DENRO43583 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DENRO43583 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DENRO43583 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DENRO43583 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DENRO43583 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DENRO43583 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DENRO43583 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DENRO43583 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DENRO43583 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DENRO43583 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DENRO43583 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DENRO43583 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DENRO43583 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DENRO43583 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DENRO43583 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DENRO43583 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DENRO43583 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DENRO43583 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DENRO43583 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
DENRO43583 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DENRO43583 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DENRO43583 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DENRO43583 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DENRO43583 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DENRO43583 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DENRO43583 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DENRO43583 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DENRO43583 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DENRO43583 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DENRO43583 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DENRO43583 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DENRO43583 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DENRO43583 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DENRO43583 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DENRO43583 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DENRO43583 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DENRO43583 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms