Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VGFO15240 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VGFO15240 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VGFO15240 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VGFO15240 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VGFO15240 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VGFO15240 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VGFO15240 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VGFO15240 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VGFO15240 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VGFO15240 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VGFO15240 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VGFO15240 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
VGFO15240 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VGFO15240 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VGFO15240 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VGFO15240 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VGFO15240 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VGFO15240 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VGFO15240 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VGFO15240 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VGFO15240 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
VGFO15240 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VGFO15240 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VGFO15240 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VGFO15240 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VGFO15240 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VGFO15240 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VGFO15240 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
VGFO15240 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VGFO15240 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VGFO15240 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VGFO15240 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
VGFO15240 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VGFO15240 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
VGFO15240 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VGFO15240 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VGFO15240 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VGFO15240 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VGFO15240 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VGFO15240 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VGFO15240 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VGFO15240 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
VGFO15240 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VGFO15240 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VGFO15240 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VGFO15240 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VGFO15240 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VGFO15240 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VGFO15240 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VGFO15240 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VGFO15240 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VGFO15240 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VGFO15240 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VGFO15240 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VGFO15240 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VGFO15240 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VGFO15240 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VGFO15240 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VGFO15240 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VGFO15240 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VGFO15240 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VGFO15240 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VGFO15240 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VGFO15240 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VGFO15240 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VGFO15240 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VGFO15240 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VGFO15240 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VGFO15240 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
VGFO15240 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VGFO15240 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VGFO15240 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VGFO15240 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VGFO15240 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VGFO15240 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VGFO15240 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VGFO15240 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VGFO15240 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VGFO15240 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VGFO15240 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VGFO15240 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VGFO15240 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VGFO15240 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VGFO15240 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VGFO15240 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VGFO15240 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VGFO15240 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VGFO15240 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VGFO15240 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VGFO15240 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VGFO15240 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VGFO15240 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VGFO15240 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VGFO15240 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VGFO15240 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VGFO15240 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VGFO15240 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VGFO15240 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VGFO15240 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms