Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SYNMO15061 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SYNMO15061 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYNMO15061 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYNMO15061 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYNMO15061 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNMO15061 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNMO15061 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNMO15061 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNMO15061 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNMO15061 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNMO15061 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNMO15061 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNMO15061 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNMO15061 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNMO15061 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNMO15061 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYNMO15061 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYNMO15061 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYNMO15061 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYNMO15061 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYNMO15061 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYNMO15061 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYNMO15061 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYNMO15061 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYNMO15061 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYNMO15061 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYNMO15061 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYNMO15061 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYNMO15061 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYNMO15061 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYNMO15061 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNMO15061 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNMO15061 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNMO15061 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNMO15061 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNMO15061 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNMO15061 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNMO15061 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNMO15061 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNMO15061 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNMO15061 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNMO15061 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNMO15061 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNMO15061 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNMO15061 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNMO15061 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNMO15061 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNMO15061 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYNMO15061 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYNMO15061 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYNMO15061 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYNMO15061 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYNMO15061 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYNMO15061 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYNMO15061 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYNMO15061 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYNMO15061 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYNMO15061 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYNMO15061 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYNMO15061 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYNMO15061 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYNMO15061 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYNMO15061 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYNMO15061 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYNMO15061 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYNMO15061 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYNMO15061 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYNMO15061 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYNMO15061 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYNMO15061 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYNMO15061 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYNMO15061 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYNMO15061 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYNMO15061 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYNMO15061 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYNMO15061 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYNMO15061 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYNMO15061 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYNMO15061 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SYNMO15061 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYNMO15061 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYNMO15061 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYNMO15061 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYNMO15061 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYNMO15061 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYNMO15061 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYNMO15061 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYNMO15061 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYNMO15061 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYNMO15061 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYNMO15061 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYNMO15061 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYNMO15061 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYNMO15061 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYNMO15061 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYNMO15061 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYNMO15061 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYNMO15061 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYNMO15061 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms