Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N3

CLCA3P, Calcium-activated chloride channel regulator family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA3PQ9Y6N3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCA3PQ9Y6N3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCA3PQ9Y6N3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCA3PQ9Y6N3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCA3PQ9Y6N3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCA3PQ9Y6N3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCA3PQ9Y6N3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCA3PQ9Y6N3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCA3PQ9Y6N3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCA3PQ9Y6N3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCA3PQ9Y6N3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCA3PQ9Y6N3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCA3PQ9Y6N3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCA3PQ9Y6N3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCA3PQ9Y6N3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCA3PQ9Y6N3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCA3PQ9Y6N3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLCA3PQ9Y6N3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLCA3PQ9Y6N3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCA3PQ9Y6N3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCA3PQ9Y6N3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCA3PQ9Y6N3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCA3PQ9Y6N3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCA3PQ9Y6N3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCA3PQ9Y6N3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCA3PQ9Y6N3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCA3PQ9Y6N3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCA3PQ9Y6N3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCA3PQ9Y6N3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCA3PQ9Y6N3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCA3PQ9Y6N3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCA3PQ9Y6N3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCA3PQ9Y6N3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCA3PQ9Y6N3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCA3PQ9Y6N3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCA3PQ9Y6N3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCA3PQ9Y6N3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCA3PQ9Y6N3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCA3PQ9Y6N3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCA3PQ9Y6N3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCA3PQ9Y6N3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCA3PQ9Y6N3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCA3PQ9Y6N3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCA3PQ9Y6N3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCA3PQ9Y6N3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCA3PQ9Y6N3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCA3PQ9Y6N3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCA3PQ9Y6N3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCA3PQ9Y6N3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCA3PQ9Y6N3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCA3PQ9Y6N3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCA3PQ9Y6N3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCA3PQ9Y6N3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCA3PQ9Y6N3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCA3PQ9Y6N3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCA3PQ9Y6N3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCA3PQ9Y6N3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCA3PQ9Y6N3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCA3PQ9Y6N3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCA3PQ9Y6N3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCA3PQ9Y6N3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCA3PQ9Y6N3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCA3PQ9Y6N3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCA3PQ9Y6N3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCA3PQ9Y6N3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCA3PQ9Y6N3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCA3PQ9Y6N3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCA3PQ9Y6N3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCA3PQ9Y6N3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCA3PQ9Y6N3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CLCA3PQ9Y6N3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCA3PQ9Y6N3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCA3PQ9Y6N3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCA3PQ9Y6N3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCA3PQ9Y6N3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCA3PQ9Y6N3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCA3PQ9Y6N3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCA3PQ9Y6N3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCA3PQ9Y6N3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCA3PQ9Y6N3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCA3PQ9Y6N3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCA3PQ9Y6N3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCA3PQ9Y6N3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCA3PQ9Y6N3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCA3PQ9Y6N3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCA3PQ9Y6N3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCA3PQ9Y6N3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCA3PQ9Y6N3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCA3PQ9Y6N3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLCA3PQ9Y6N3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLCA3PQ9Y6N3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLCA3PQ9Y6N3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLCA3PQ9Y6N3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCA3PQ9Y6N3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCA3PQ9Y6N3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCA3PQ9Y6N3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCA3PQ9Y6N3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLCA3PQ9Y6N3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CLCA3PQ9Y6N3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLCA3PQ9Y6N3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms