Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y664

KPTN, KICSTOR complex protein kaptin, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPTNQ9Y664 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KPTNQ9Y664 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPTNQ9Y664 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KPTNQ9Y664 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPTNQ9Y664 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPTNQ9Y664 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPTNQ9Y664 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPTNQ9Y664 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KPTNQ9Y664 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KPTNQ9Y664 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KPTNQ9Y664 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KPTNQ9Y664 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KPTNQ9Y664 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KPTNQ9Y664 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KPTNQ9Y664 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KPTNQ9Y664 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KPTNQ9Y664 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KPTNQ9Y664 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KPTNQ9Y664 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KPTNQ9Y664 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPTNQ9Y664 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPTNQ9Y664 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPTNQ9Y664 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KPTNQ9Y664 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPTNQ9Y664 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPTNQ9Y664 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KPTNQ9Y664 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KPTNQ9Y664 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPTNQ9Y664 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPTNQ9Y664 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPTNQ9Y664 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPTNQ9Y664 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPTNQ9Y664 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPTNQ9Y664 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPTNQ9Y664 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KPTNQ9Y664 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KPTNQ9Y664 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KPTNQ9Y664 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KPTNQ9Y664 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KPTNQ9Y664 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KPTNQ9Y664 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KPTNQ9Y664 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KPTNQ9Y664 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KPTNQ9Y664 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KPTNQ9Y664 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KPTNQ9Y664 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KPTNQ9Y664 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KPTNQ9Y664 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KPTNQ9Y664 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KPTNQ9Y664 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KPTNQ9Y664 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KPTNQ9Y664 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KPTNQ9Y664 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KPTNQ9Y664 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KPTNQ9Y664 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KPTNQ9Y664 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KPTNQ9Y664 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KPTNQ9Y664 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KPTNQ9Y664 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KPTNQ9Y664 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KPTNQ9Y664 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KPTNQ9Y664 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KPTNQ9Y664 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KPTNQ9Y664 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KPTNQ9Y664 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KPTNQ9Y664 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KPTNQ9Y664 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KPTNQ9Y664 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KPTNQ9Y664 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KPTNQ9Y664 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KPTNQ9Y664 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KPTNQ9Y664 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KPTNQ9Y664 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KPTNQ9Y664 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KPTNQ9Y664 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KPTNQ9Y664 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KPTNQ9Y664 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KPTNQ9Y664 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KPTNQ9Y664 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KPTNQ9Y664 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KPTNQ9Y664 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KPTNQ9Y664 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KPTNQ9Y664 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KPTNQ9Y664 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KPTNQ9Y664 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KPTNQ9Y664 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KPTNQ9Y664 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KPTNQ9Y664 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KPTNQ9Y664 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KPTNQ9Y664 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KPTNQ9Y664 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KPTNQ9Y664 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KPTNQ9Y664 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KPTNQ9Y664 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KPTNQ9Y664 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KPTNQ9Y664 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KPTNQ9Y664 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KPTNQ9Y664 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KPTNQ9Y664 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KPTNQ9Y664 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms