Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4G8

RAPGEF2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF2Q9Y4G8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.63■■■■■ 4.57
RAPGEF2Q9Y4G8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
RAPGEF2Q9Y4G8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
RAPGEF2Q9Y4G8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
RAPGEF2Q9Y4G8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.6■■■■■ 4.57
RAPGEF2Q9Y4G8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
RAPGEF2Q9Y4G8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
RAPGEF2Q9Y4G8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
RAPGEF2Q9Y4G8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
RAPGEF2Q9Y4G8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
RAPGEF2Q9Y4G8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
RAPGEF2Q9Y4G8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
RAPGEF2Q9Y4G8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC43.55■■■■■ 4.56
RAPGEF2Q9Y4G8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.55■■■■■ 4.56
RAPGEF2Q9Y4G8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
RAPGEF2Q9Y4G8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC43.51■■■■■ 4.56
RAPGEF2Q9Y4G8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
RAPGEF2Q9Y4G8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
RAPGEF2Q9Y4G8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
RAPGEF2Q9Y4G8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
RAPGEF2Q9Y4G8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
RAPGEF2Q9Y4G8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
RAPGEF2Q9Y4G8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
RAPGEF2Q9Y4G8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
RAPGEF2Q9Y4G8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
RAPGEF2Q9Y4G8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
RAPGEF2Q9Y4G8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
RAPGEF2Q9Y4G8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
RAPGEF2Q9Y4G8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
RAPGEF2Q9Y4G8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
RAPGEF2Q9Y4G8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
RAPGEF2Q9Y4G8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
RAPGEF2Q9Y4G8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC43.41■■■■■ 4.54
RAPGEF2Q9Y4G8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
RAPGEF2Q9Y4G8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
RAPGEF2Q9Y4G8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
RAPGEF2Q9Y4G8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
RAPGEF2Q9Y4G8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
RAPGEF2Q9Y4G8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
RAPGEF2Q9Y4G8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
RAPGEF2Q9Y4G8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
RAPGEF2Q9Y4G8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
RAPGEF2Q9Y4G8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
RAPGEF2Q9Y4G8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
RAPGEF2Q9Y4G8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
RAPGEF2Q9Y4G8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
RAPGEF2Q9Y4G8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
RAPGEF2Q9Y4G8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
RAPGEF2Q9Y4G8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.54
RAPGEF2Q9Y4G8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
RAPGEF2Q9Y4G8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
RAPGEF2Q9Y4G8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
RAPGEF2Q9Y4G8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
RAPGEF2Q9Y4G8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
RAPGEF2Q9Y4G8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC43.35■■■■■ 4.53
RAPGEF2Q9Y4G8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
RAPGEF2Q9Y4G8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
RAPGEF2Q9Y4G8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
RAPGEF2Q9Y4G8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
RAPGEF2Q9Y4G8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
RAPGEF2Q9Y4G8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
RAPGEF2Q9Y4G8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
RAPGEF2Q9Y4G8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
RAPGEF2Q9Y4G8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
RAPGEF2Q9Y4G8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
RAPGEF2Q9Y4G8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
RAPGEF2Q9Y4G8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
RAPGEF2Q9Y4G8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
RAPGEF2Q9Y4G8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC43.21■■■■■ 4.51
RAPGEF2Q9Y4G8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
RAPGEF2Q9Y4G8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
RAPGEF2Q9Y4G8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
RAPGEF2Q9Y4G8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
RAPGEF2Q9Y4G8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.5
RAPGEF2Q9Y4G8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC43.19■■■■■ 4.5
RAPGEF2Q9Y4G8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.5
RAPGEF2Q9Y4G8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC43.17■■■■■ 4.5
RAPGEF2Q9Y4G8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
RAPGEF2Q9Y4G8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
RAPGEF2Q9Y4G8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
RAPGEF2Q9Y4G8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
RAPGEF2Q9Y4G8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
RAPGEF2Q9Y4G8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
RAPGEF2Q9Y4G8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.49
RAPGEF2Q9Y4G8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC43.13■■■■■ 4.49
RAPGEF2Q9Y4G8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
RAPGEF2Q9Y4G8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
RAPGEF2Q9Y4G8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
RAPGEF2Q9Y4G8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
RAPGEF2Q9Y4G8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
RAPGEF2Q9Y4G8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
RAPGEF2Q9Y4G8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
RAPGEF2Q9Y4G8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
RAPGEF2Q9Y4G8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
RAPGEF2Q9Y4G8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
RAPGEF2Q9Y4G8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.05■■■■■ 4.48
RAPGEF2Q9Y4G8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
RAPGEF2Q9Y4G8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
RAPGEF2Q9Y4G8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms