Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y467

SALL2, Sal-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL2Q9Y467 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SALL2Q9Y467 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SALL2Q9Y467 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SALL2Q9Y467 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SALL2Q9Y467 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SALL2Q9Y467 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SALL2Q9Y467 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SALL2Q9Y467 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
SALL2Q9Y467 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SALL2Q9Y467 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SALL2Q9Y467 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SALL2Q9Y467 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SALL2Q9Y467 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SALL2Q9Y467 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SALL2Q9Y467 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SALL2Q9Y467 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SALL2Q9Y467 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SALL2Q9Y467 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SALL2Q9Y467 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SALL2Q9Y467 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SALL2Q9Y467 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SALL2Q9Y467 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SALL2Q9Y467 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SALL2Q9Y467 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SALL2Q9Y467 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SALL2Q9Y467 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SALL2Q9Y467 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SALL2Q9Y467 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SALL2Q9Y467 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
SALL2Q9Y467 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
SALL2Q9Y467 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SALL2Q9Y467 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SALL2Q9Y467 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SALL2Q9Y467 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SALL2Q9Y467 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SALL2Q9Y467 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SALL2Q9Y467 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SALL2Q9Y467 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SALL2Q9Y467 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SALL2Q9Y467 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SALL2Q9Y467 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SALL2Q9Y467 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SALL2Q9Y467 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SALL2Q9Y467 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SALL2Q9Y467 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SALL2Q9Y467 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
SALL2Q9Y467 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SALL2Q9Y467 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SALL2Q9Y467 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SALL2Q9Y467 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SALL2Q9Y467 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SALL2Q9Y467 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SALL2Q9Y467 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SALL2Q9Y467 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SALL2Q9Y467 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
SALL2Q9Y467 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SALL2Q9Y467 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SALL2Q9Y467 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SALL2Q9Y467 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
SALL2Q9Y467 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SALL2Q9Y467 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SALL2Q9Y467 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SALL2Q9Y467 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SALL2Q9Y467 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SALL2Q9Y467 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SALL2Q9Y467 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SALL2Q9Y467 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SALL2Q9Y467 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SALL2Q9Y467 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SALL2Q9Y467 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SALL2Q9Y467 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
SALL2Q9Y467 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
SALL2Q9Y467 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SALL2Q9Y467 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SALL2Q9Y467 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SALL2Q9Y467 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SALL2Q9Y467 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SALL2Q9Y467 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SALL2Q9Y467 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SALL2Q9Y467 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SALL2Q9Y467 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SALL2Q9Y467 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SALL2Q9Y467 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SALL2Q9Y467 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SALL2Q9Y467 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SALL2Q9Y467 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SALL2Q9Y467 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SALL2Q9Y467 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SALL2Q9Y467 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SALL2Q9Y467 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SALL2Q9Y467 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SALL2Q9Y467 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SALL2Q9Y467 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SALL2Q9Y467 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SALL2Q9Y467 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SALL2Q9Y467 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SALL2Q9Y467 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SALL2Q9Y467 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SALL2Q9Y467 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SALL2Q9Y467 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms