Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ZNF330Q9Y3S2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ZNF330Q9Y3S2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ZNF330Q9Y3S2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZNF330Q9Y3S2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZNF330Q9Y3S2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZNF330Q9Y3S2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ZNF330Q9Y3S2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ZNF330Q9Y3S2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ZNF330Q9Y3S2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ZNF330Q9Y3S2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ZNF330Q9Y3S2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ZNF330Q9Y3S2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ZNF330Q9Y3S2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ZNF330Q9Y3S2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.79■■■■□ 3
ZNF330Q9Y3S2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ZNF330Q9Y3S2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ZNF330Q9Y3S2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ZNF330Q9Y3S2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ZNF330Q9Y3S2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ZNF330Q9Y3S2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ZNF330Q9Y3S2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ZNF330Q9Y3S2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ZNF330Q9Y3S2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ZNF330Q9Y3S2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ZNF330Q9Y3S2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ZNF330Q9Y3S2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ZNF330Q9Y3S2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ZNF330Q9Y3S2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
ZNF330Q9Y3S2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ZNF330Q9Y3S2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ZNF330Q9Y3S2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ZNF330Q9Y3S2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZNF330Q9Y3S2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZNF330Q9Y3S2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ZNF330Q9Y3S2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ZNF330Q9Y3S2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ZNF330Q9Y3S2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ZNF330Q9Y3S2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ZNF330Q9Y3S2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ZNF330Q9Y3S2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ZNF330Q9Y3S2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
ZNF330Q9Y3S2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
ZNF330Q9Y3S2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
ZNF330Q9Y3S2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
ZNF330Q9Y3S2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
ZNF330Q9Y3S2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
ZNF330Q9Y3S2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
ZNF330Q9Y3S2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
ZNF330Q9Y3S2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
ZNF330Q9Y3S2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZNF330Q9Y3S2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZNF330Q9Y3S2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZNF330Q9Y3S2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ZNF330Q9Y3S2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
ZNF330Q9Y3S2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ZNF330Q9Y3S2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ZNF330Q9Y3S2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ZNF330Q9Y3S2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZNF330Q9Y3S2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZNF330Q9Y3S2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ZNF330Q9Y3S2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ZNF330Q9Y3S2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ZNF330Q9Y3S2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ZNF330Q9Y3S2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ZNF330Q9Y3S2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ZNF330Q9Y3S2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ZNF330Q9Y3S2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ZNF330Q9Y3S2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ZNF330Q9Y3S2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ZNF330Q9Y3S2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ZNF330Q9Y3S2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ZNF330Q9Y3S2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ZNF330Q9Y3S2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ZNF330Q9Y3S2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ZNF330Q9Y3S2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
ZNF330Q9Y3S2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ZNF330Q9Y3S2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ZNF330Q9Y3S2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ZNF330Q9Y3S2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ZNF330Q9Y3S2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
ZNF330Q9Y3S2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ZNF330Q9Y3S2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ZNF330Q9Y3S2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ZNF330Q9Y3S2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ZNF330Q9Y3S2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ZNF330Q9Y3S2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ZNF330Q9Y3S2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ZNF330Q9Y3S2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ZNF330Q9Y3S2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ZNF330Q9Y3S2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ZNF330Q9Y3S2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ZNF330Q9Y3S2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ZNF330Q9Y3S2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ZNF330Q9Y3S2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ZNF330Q9Y3S2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ZNF330Q9Y3S2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
ZNF330Q9Y3S2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ZNF330Q9Y3S2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ZNF330Q9Y3S2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms