Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SH3BP1Q9Y3L3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SH3BP1Q9Y3L3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SH3BP1Q9Y3L3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SH3BP1Q9Y3L3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SH3BP1Q9Y3L3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SH3BP1Q9Y3L3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SH3BP1Q9Y3L3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SH3BP1Q9Y3L3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SH3BP1Q9Y3L3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SH3BP1Q9Y3L3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SH3BP1Q9Y3L3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SH3BP1Q9Y3L3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SH3BP1Q9Y3L3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SH3BP1Q9Y3L3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SH3BP1Q9Y3L3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH3BP1Q9Y3L3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH3BP1Q9Y3L3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH3BP1Q9Y3L3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH3BP1Q9Y3L3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH3BP1Q9Y3L3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH3BP1Q9Y3L3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH3BP1Q9Y3L3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH3BP1Q9Y3L3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SH3BP1Q9Y3L3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3BP1Q9Y3L3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3BP1Q9Y3L3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3BP1Q9Y3L3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH3BP1Q9Y3L3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH3BP1Q9Y3L3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH3BP1Q9Y3L3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3BP1Q9Y3L3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3BP1Q9Y3L3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SH3BP1Q9Y3L3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3BP1Q9Y3L3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3BP1Q9Y3L3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3BP1Q9Y3L3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3BP1Q9Y3L3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3BP1Q9Y3L3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3BP1Q9Y3L3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3BP1Q9Y3L3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SH3BP1Q9Y3L3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SH3BP1Q9Y3L3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SH3BP1Q9Y3L3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH3BP1Q9Y3L3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH3BP1Q9Y3L3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SH3BP1Q9Y3L3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SH3BP1Q9Y3L3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SH3BP1Q9Y3L3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH3BP1Q9Y3L3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH3BP1Q9Y3L3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SH3BP1Q9Y3L3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SH3BP1Q9Y3L3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH3BP1Q9Y3L3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SH3BP1Q9Y3L3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH3BP1Q9Y3L3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH3BP1Q9Y3L3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH3BP1Q9Y3L3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH3BP1Q9Y3L3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SH3BP1Q9Y3L3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SH3BP1Q9Y3L3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH3BP1Q9Y3L3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SH3BP1Q9Y3L3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH3BP1Q9Y3L3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH3BP1Q9Y3L3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH3BP1Q9Y3L3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH3BP1Q9Y3L3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH3BP1Q9Y3L3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH3BP1Q9Y3L3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3BP1Q9Y3L3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3BP1Q9Y3L3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3BP1Q9Y3L3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3BP1Q9Y3L3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH3BP1Q9Y3L3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3BP1Q9Y3L3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3BP1Q9Y3L3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3BP1Q9Y3L3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SH3BP1Q9Y3L3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SH3BP1Q9Y3L3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms