Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C1

NOP16, Nucleolar protein 16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP16Q9Y3C1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOP16Q9Y3C1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOP16Q9Y3C1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOP16Q9Y3C1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOP16Q9Y3C1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NOP16Q9Y3C1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOP16Q9Y3C1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOP16Q9Y3C1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOP16Q9Y3C1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOP16Q9Y3C1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOP16Q9Y3C1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOP16Q9Y3C1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOP16Q9Y3C1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOP16Q9Y3C1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOP16Q9Y3C1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOP16Q9Y3C1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NOP16Q9Y3C1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOP16Q9Y3C1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOP16Q9Y3C1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NOP16Q9Y3C1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NOP16Q9Y3C1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOP16Q9Y3C1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOP16Q9Y3C1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOP16Q9Y3C1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOP16Q9Y3C1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOP16Q9Y3C1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOP16Q9Y3C1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOP16Q9Y3C1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOP16Q9Y3C1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOP16Q9Y3C1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOP16Q9Y3C1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NOP16Q9Y3C1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOP16Q9Y3C1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOP16Q9Y3C1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOP16Q9Y3C1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOP16Q9Y3C1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOP16Q9Y3C1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOP16Q9Y3C1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOP16Q9Y3C1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOP16Q9Y3C1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOP16Q9Y3C1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NOP16Q9Y3C1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NOP16Q9Y3C1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOP16Q9Y3C1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOP16Q9Y3C1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOP16Q9Y3C1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NOP16Q9Y3C1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOP16Q9Y3C1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOP16Q9Y3C1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NOP16Q9Y3C1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOP16Q9Y3C1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NOP16Q9Y3C1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOP16Q9Y3C1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOP16Q9Y3C1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOP16Q9Y3C1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOP16Q9Y3C1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOP16Q9Y3C1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOP16Q9Y3C1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOP16Q9Y3C1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NOP16Q9Y3C1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOP16Q9Y3C1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOP16Q9Y3C1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOP16Q9Y3C1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOP16Q9Y3C1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOP16Q9Y3C1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOP16Q9Y3C1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOP16Q9Y3C1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOP16Q9Y3C1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOP16Q9Y3C1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOP16Q9Y3C1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOP16Q9Y3C1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NOP16Q9Y3C1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NOP16Q9Y3C1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOP16Q9Y3C1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOP16Q9Y3C1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOP16Q9Y3C1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOP16Q9Y3C1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOP16Q9Y3C1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOP16Q9Y3C1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOP16Q9Y3C1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOP16Q9Y3C1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOP16Q9Y3C1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOP16Q9Y3C1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOP16Q9Y3C1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOP16Q9Y3C1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOP16Q9Y3C1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOP16Q9Y3C1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOP16Q9Y3C1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOP16Q9Y3C1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NOP16Q9Y3C1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOP16Q9Y3C1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOP16Q9Y3C1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOP16Q9Y3C1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOP16Q9Y3C1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOP16Q9Y3C1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOP16Q9Y3C1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOP16Q9Y3C1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOP16Q9Y3C1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOP16Q9Y3C1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOP16Q9Y3C1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms