Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL20Q9Y2M5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL20Q9Y2M5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL20Q9Y2M5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL20Q9Y2M5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL20Q9Y2M5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL20Q9Y2M5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL20Q9Y2M5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL20Q9Y2M5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL20Q9Y2M5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL20Q9Y2M5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL20Q9Y2M5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL20Q9Y2M5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL20Q9Y2M5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL20Q9Y2M5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL20Q9Y2M5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL20Q9Y2M5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL20Q9Y2M5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL20Q9Y2M5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL20Q9Y2M5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL20Q9Y2M5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL20Q9Y2M5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL20Q9Y2M5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL20Q9Y2M5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL20Q9Y2M5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL20Q9Y2M5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL20Q9Y2M5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL20Q9Y2M5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KLHL20Q9Y2M5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL20Q9Y2M5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL20Q9Y2M5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL20Q9Y2M5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms