Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J0

RPH3A, Rabphilin-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPH3AQ9Y2J0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPH3AQ9Y2J0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPH3AQ9Y2J0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPH3AQ9Y2J0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPH3AQ9Y2J0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPH3AQ9Y2J0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPH3AQ9Y2J0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RPH3AQ9Y2J0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPH3AQ9Y2J0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPH3AQ9Y2J0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPH3AQ9Y2J0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPH3AQ9Y2J0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPH3AQ9Y2J0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPH3AQ9Y2J0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPH3AQ9Y2J0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPH3AQ9Y2J0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPH3AQ9Y2J0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPH3AQ9Y2J0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RPH3AQ9Y2J0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RPH3AQ9Y2J0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPH3AQ9Y2J0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPH3AQ9Y2J0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPH3AQ9Y2J0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPH3AQ9Y2J0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPH3AQ9Y2J0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPH3AQ9Y2J0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPH3AQ9Y2J0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPH3AQ9Y2J0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPH3AQ9Y2J0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPH3AQ9Y2J0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPH3AQ9Y2J0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPH3AQ9Y2J0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RPH3AQ9Y2J0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RPH3AQ9Y2J0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPH3AQ9Y2J0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPH3AQ9Y2J0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPH3AQ9Y2J0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPH3AQ9Y2J0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPH3AQ9Y2J0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPH3AQ9Y2J0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPH3AQ9Y2J0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPH3AQ9Y2J0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPH3AQ9Y2J0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPH3AQ9Y2J0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPH3AQ9Y2J0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPH3AQ9Y2J0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPH3AQ9Y2J0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPH3AQ9Y2J0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPH3AQ9Y2J0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPH3AQ9Y2J0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPH3AQ9Y2J0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPH3AQ9Y2J0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPH3AQ9Y2J0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPH3AQ9Y2J0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RPH3AQ9Y2J0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPH3AQ9Y2J0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RPH3AQ9Y2J0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPH3AQ9Y2J0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPH3AQ9Y2J0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPH3AQ9Y2J0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPH3AQ9Y2J0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPH3AQ9Y2J0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPH3AQ9Y2J0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPH3AQ9Y2J0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPH3AQ9Y2J0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPH3AQ9Y2J0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RPH3AQ9Y2J0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPH3AQ9Y2J0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPH3AQ9Y2J0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPH3AQ9Y2J0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPH3AQ9Y2J0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPH3AQ9Y2J0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPH3AQ9Y2J0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPH3AQ9Y2J0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPH3AQ9Y2J0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RPH3AQ9Y2J0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPH3AQ9Y2J0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RPH3AQ9Y2J0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPH3AQ9Y2J0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPH3AQ9Y2J0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPH3AQ9Y2J0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPH3AQ9Y2J0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPH3AQ9Y2J0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPH3AQ9Y2J0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPH3AQ9Y2J0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPH3AQ9Y2J0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPH3AQ9Y2J0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPH3AQ9Y2J0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPH3AQ9Y2J0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPH3AQ9Y2J0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPH3AQ9Y2J0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPH3AQ9Y2J0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPH3AQ9Y2J0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPH3AQ9Y2J0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPH3AQ9Y2J0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPH3AQ9Y2J0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPH3AQ9Y2J0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPH3AQ9Y2J0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPH3AQ9Y2J0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPH3AQ9Y2J0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms