Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTNND2Q9UQB3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CTNND2Q9UQB3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTNND2Q9UQB3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTNND2Q9UQB3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTNND2Q9UQB3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTNND2Q9UQB3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTNND2Q9UQB3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTNND2Q9UQB3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTNND2Q9UQB3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTNND2Q9UQB3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTNND2Q9UQB3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTNND2Q9UQB3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTNND2Q9UQB3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTNND2Q9UQB3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTNND2Q9UQB3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTNND2Q9UQB3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTNND2Q9UQB3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTNND2Q9UQB3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTNND2Q9UQB3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTNND2Q9UQB3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTNND2Q9UQB3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTNND2Q9UQB3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CTNND2Q9UQB3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTNND2Q9UQB3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTNND2Q9UQB3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTNND2Q9UQB3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTNND2Q9UQB3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CTNND2Q9UQB3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTNND2Q9UQB3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CTNND2Q9UQB3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTNND2Q9UQB3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CTNND2Q9UQB3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTNND2Q9UQB3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTNND2Q9UQB3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTNND2Q9UQB3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTNND2Q9UQB3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTNND2Q9UQB3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTNND2Q9UQB3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CTNND2Q9UQB3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTNND2Q9UQB3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CTNND2Q9UQB3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTNND2Q9UQB3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTNND2Q9UQB3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTNND2Q9UQB3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTNND2Q9UQB3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTNND2Q9UQB3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTNND2Q9UQB3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTNND2Q9UQB3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTNND2Q9UQB3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTNND2Q9UQB3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTNND2Q9UQB3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CTNND2Q9UQB3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CTNND2Q9UQB3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTNND2Q9UQB3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTNND2Q9UQB3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTNND2Q9UQB3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTNND2Q9UQB3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CTNND2Q9UQB3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTNND2Q9UQB3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTNND2Q9UQB3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTNND2Q9UQB3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTNND2Q9UQB3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTNND2Q9UQB3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CTNND2Q9UQB3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTNND2Q9UQB3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTNND2Q9UQB3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTNND2Q9UQB3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTNND2Q9UQB3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTNND2Q9UQB3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTNND2Q9UQB3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTNND2Q9UQB3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTNND2Q9UQB3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTNND2Q9UQB3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTNND2Q9UQB3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTNND2Q9UQB3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTNND2Q9UQB3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTNND2Q9UQB3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTNND2Q9UQB3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTNND2Q9UQB3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTNND2Q9UQB3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTNND2Q9UQB3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTNND2Q9UQB3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTNND2Q9UQB3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTNND2Q9UQB3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTNND2Q9UQB3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTNND2Q9UQB3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTNND2Q9UQB3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTNND2Q9UQB3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTNND2Q9UQB3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTNND2Q9UQB3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTNND2Q9UQB3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTNND2Q9UQB3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTNND2Q9UQB3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CTNND2Q9UQB3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTNND2Q9UQB3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTNND2Q9UQB3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTNND2Q9UQB3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTNND2Q9UQB3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTNND2Q9UQB3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms