Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE7

STUB1, E3 ubiquitin-protein ligase CHIP, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STUB1Q9UNE7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STUB1Q9UNE7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STUB1Q9UNE7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STUB1Q9UNE7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STUB1Q9UNE7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STUB1Q9UNE7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STUB1Q9UNE7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STUB1Q9UNE7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STUB1Q9UNE7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STUB1Q9UNE7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STUB1Q9UNE7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STUB1Q9UNE7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STUB1Q9UNE7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STUB1Q9UNE7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STUB1Q9UNE7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STUB1Q9UNE7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STUB1Q9UNE7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STUB1Q9UNE7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STUB1Q9UNE7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STUB1Q9UNE7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STUB1Q9UNE7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STUB1Q9UNE7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STUB1Q9UNE7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STUB1Q9UNE7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STUB1Q9UNE7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STUB1Q9UNE7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STUB1Q9UNE7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STUB1Q9UNE7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STUB1Q9UNE7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STUB1Q9UNE7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
STUB1Q9UNE7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STUB1Q9UNE7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STUB1Q9UNE7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STUB1Q9UNE7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STUB1Q9UNE7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STUB1Q9UNE7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STUB1Q9UNE7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STUB1Q9UNE7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STUB1Q9UNE7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STUB1Q9UNE7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STUB1Q9UNE7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 456 ms