Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM19

HPCAL4, Hippocalcin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL4Q9UM19 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HPCAL4Q9UM19 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HPCAL4Q9UM19 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HPCAL4Q9UM19 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HPCAL4Q9UM19 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HPCAL4Q9UM19 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HPCAL4Q9UM19 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HPCAL4Q9UM19 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
HPCAL4Q9UM19 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HPCAL4Q9UM19 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HPCAL4Q9UM19 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HPCAL4Q9UM19 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HPCAL4Q9UM19 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HPCAL4Q9UM19 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HPCAL4Q9UM19 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HPCAL4Q9UM19 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HPCAL4Q9UM19 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HPCAL4Q9UM19 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HPCAL4Q9UM19 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HPCAL4Q9UM19 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HPCAL4Q9UM19 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HPCAL4Q9UM19 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HPCAL4Q9UM19 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HPCAL4Q9UM19 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HPCAL4Q9UM19 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HPCAL4Q9UM19 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HPCAL4Q9UM19 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HPCAL4Q9UM19 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HPCAL4Q9UM19 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HPCAL4Q9UM19 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HPCAL4Q9UM19 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HPCAL4Q9UM19 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HPCAL4Q9UM19 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HPCAL4Q9UM19 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HPCAL4Q9UM19 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HPCAL4Q9UM19 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HPCAL4Q9UM19 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HPCAL4Q9UM19 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HPCAL4Q9UM19 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HPCAL4Q9UM19 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HPCAL4Q9UM19 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HPCAL4Q9UM19 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HPCAL4Q9UM19 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HPCAL4Q9UM19 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HPCAL4Q9UM19 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HPCAL4Q9UM19 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HPCAL4Q9UM19 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HPCAL4Q9UM19 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HPCAL4Q9UM19 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HPCAL4Q9UM19 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HPCAL4Q9UM19 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HPCAL4Q9UM19 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HPCAL4Q9UM19 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HPCAL4Q9UM19 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HPCAL4Q9UM19 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HPCAL4Q9UM19 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HPCAL4Q9UM19 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HPCAL4Q9UM19 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HPCAL4Q9UM19 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HPCAL4Q9UM19 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HPCAL4Q9UM19 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HPCAL4Q9UM19 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HPCAL4Q9UM19 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HPCAL4Q9UM19 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HPCAL4Q9UM19 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HPCAL4Q9UM19 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HPCAL4Q9UM19 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HPCAL4Q9UM19 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HPCAL4Q9UM19 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HPCAL4Q9UM19 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HPCAL4Q9UM19 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HPCAL4Q9UM19 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HPCAL4Q9UM19 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HPCAL4Q9UM19 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HPCAL4Q9UM19 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HPCAL4Q9UM19 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HPCAL4Q9UM19 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HPCAL4Q9UM19 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HPCAL4Q9UM19 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HPCAL4Q9UM19 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HPCAL4Q9UM19 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HPCAL4Q9UM19 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HPCAL4Q9UM19 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HPCAL4Q9UM19 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HPCAL4Q9UM19 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HPCAL4Q9UM19 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HPCAL4Q9UM19 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HPCAL4Q9UM19 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HPCAL4Q9UM19 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HPCAL4Q9UM19 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HPCAL4Q9UM19 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HPCAL4Q9UM19 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HPCAL4Q9UM19 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HPCAL4Q9UM19 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HPCAL4Q9UM19 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HPCAL4Q9UM19 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HPCAL4Q9UM19 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HPCAL4Q9UM19 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HPCAL4Q9UM19 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HPCAL4Q9UM19 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.7 ms