Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APPL1Q9UKG1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APPL1Q9UKG1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APPL1Q9UKG1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APPL1Q9UKG1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
APPL1Q9UKG1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APPL1Q9UKG1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APPL1Q9UKG1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APPL1Q9UKG1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APPL1Q9UKG1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APPL1Q9UKG1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APPL1Q9UKG1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APPL1Q9UKG1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
APPL1Q9UKG1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APPL1Q9UKG1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APPL1Q9UKG1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APPL1Q9UKG1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
APPL1Q9UKG1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
APPL1Q9UKG1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APPL1Q9UKG1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APPL1Q9UKG1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APPL1Q9UKG1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
APPL1Q9UKG1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
APPL1Q9UKG1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
APPL1Q9UKG1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APPL1Q9UKG1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APPL1Q9UKG1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APPL1Q9UKG1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APPL1Q9UKG1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APPL1Q9UKG1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APPL1Q9UKG1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APPL1Q9UKG1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APPL1Q9UKG1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APPL1Q9UKG1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
APPL1Q9UKG1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APPL1Q9UKG1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APPL1Q9UKG1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APPL1Q9UKG1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APPL1Q9UKG1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APPL1Q9UKG1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APPL1Q9UKG1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APPL1Q9UKG1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APPL1Q9UKG1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APPL1Q9UKG1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APPL1Q9UKG1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APPL1Q9UKG1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APPL1Q9UKG1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
APPL1Q9UKG1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APPL1Q9UKG1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APPL1Q9UKG1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APPL1Q9UKG1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APPL1Q9UKG1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APPL1Q9UKG1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APPL1Q9UKG1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
APPL1Q9UKG1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APPL1Q9UKG1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
APPL1Q9UKG1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APPL1Q9UKG1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APPL1Q9UKG1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APPL1Q9UKG1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APPL1Q9UKG1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APPL1Q9UKG1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APPL1Q9UKG1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APPL1Q9UKG1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APPL1Q9UKG1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APPL1Q9UKG1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APPL1Q9UKG1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
APPL1Q9UKG1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APPL1Q9UKG1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APPL1Q9UKG1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APPL1Q9UKG1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APPL1Q9UKG1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APPL1Q9UKG1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APPL1Q9UKG1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APPL1Q9UKG1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APPL1Q9UKG1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APPL1Q9UKG1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APPL1Q9UKG1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APPL1Q9UKG1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APPL1Q9UKG1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APPL1Q9UKG1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APPL1Q9UKG1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APPL1Q9UKG1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APPL1Q9UKG1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APPL1Q9UKG1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APPL1Q9UKG1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APPL1Q9UKG1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APPL1Q9UKG1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APPL1Q9UKG1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APPL1Q9UKG1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APPL1Q9UKG1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APPL1Q9UKG1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
APPL1Q9UKG1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
APPL1Q9UKG1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APPL1Q9UKG1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APPL1Q9UKG1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
APPL1Q9UKG1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APPL1Q9UKG1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APPL1Q9UKG1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APPL1Q9UKG1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms