Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MID2Q9UJV3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MID2Q9UJV3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MID2Q9UJV3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MID2Q9UJV3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MID2Q9UJV3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MID2Q9UJV3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MID2Q9UJV3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MID2Q9UJV3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MID2Q9UJV3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MID2Q9UJV3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MID2Q9UJV3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MID2Q9UJV3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MID2Q9UJV3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MID2Q9UJV3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MID2Q9UJV3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MID2Q9UJV3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MID2Q9UJV3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MID2Q9UJV3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MID2Q9UJV3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MID2Q9UJV3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MID2Q9UJV3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MID2Q9UJV3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MID2Q9UJV3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MID2Q9UJV3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MID2Q9UJV3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MID2Q9UJV3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MID2Q9UJV3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MID2Q9UJV3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MID2Q9UJV3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MID2Q9UJV3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MID2Q9UJV3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MID2Q9UJV3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MID2Q9UJV3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MID2Q9UJV3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MID2Q9UJV3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MID2Q9UJV3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MID2Q9UJV3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MID2Q9UJV3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MID2Q9UJV3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MID2Q9UJV3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MID2Q9UJV3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MID2Q9UJV3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MID2Q9UJV3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MID2Q9UJV3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MID2Q9UJV3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MID2Q9UJV3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MID2Q9UJV3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MID2Q9UJV3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MID2Q9UJV3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MID2Q9UJV3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MID2Q9UJV3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MID2Q9UJV3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MID2Q9UJV3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MID2Q9UJV3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MID2Q9UJV3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MID2Q9UJV3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MID2Q9UJV3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MID2Q9UJV3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MID2Q9UJV3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MID2Q9UJV3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MID2Q9UJV3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MID2Q9UJV3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MID2Q9UJV3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MID2Q9UJV3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MID2Q9UJV3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MID2Q9UJV3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MID2Q9UJV3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MID2Q9UJV3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MID2Q9UJV3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MID2Q9UJV3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MID2Q9UJV3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MID2Q9UJV3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MID2Q9UJV3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MID2Q9UJV3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MID2Q9UJV3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MID2Q9UJV3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MID2Q9UJV3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MID2Q9UJV3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MID2Q9UJV3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MID2Q9UJV3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MID2Q9UJV3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MID2Q9UJV3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MID2Q9UJV3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MID2Q9UJV3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MID2Q9UJV3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MID2Q9UJV3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MID2Q9UJV3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MID2Q9UJV3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MID2Q9UJV3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MID2Q9UJV3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MID2Q9UJV3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms