Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSR3Q9UJK0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TSR3Q9UJK0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSR3Q9UJK0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TSR3Q9UJK0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSR3Q9UJK0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSR3Q9UJK0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSR3Q9UJK0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSR3Q9UJK0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSR3Q9UJK0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSR3Q9UJK0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSR3Q9UJK0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSR3Q9UJK0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSR3Q9UJK0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TSR3Q9UJK0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSR3Q9UJK0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TSR3Q9UJK0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSR3Q9UJK0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSR3Q9UJK0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSR3Q9UJK0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSR3Q9UJK0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSR3Q9UJK0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSR3Q9UJK0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TSR3Q9UJK0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TSR3Q9UJK0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSR3Q9UJK0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSR3Q9UJK0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSR3Q9UJK0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSR3Q9UJK0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSR3Q9UJK0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSR3Q9UJK0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSR3Q9UJK0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSR3Q9UJK0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TSR3Q9UJK0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSR3Q9UJK0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR3Q9UJK0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSR3Q9UJK0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSR3Q9UJK0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSR3Q9UJK0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSR3Q9UJK0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSR3Q9UJK0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSR3Q9UJK0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSR3Q9UJK0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSR3Q9UJK0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSR3Q9UJK0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSR3Q9UJK0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSR3Q9UJK0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSR3Q9UJK0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSR3Q9UJK0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSR3Q9UJK0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSR3Q9UJK0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSR3Q9UJK0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSR3Q9UJK0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TSR3Q9UJK0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSR3Q9UJK0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSR3Q9UJK0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSR3Q9UJK0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSR3Q9UJK0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSR3Q9UJK0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSR3Q9UJK0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSR3Q9UJK0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR3Q9UJK0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR3Q9UJK0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR3Q9UJK0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR3Q9UJK0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR3Q9UJK0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR3Q9UJK0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR3Q9UJK0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR3Q9UJK0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSR3Q9UJK0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSR3Q9UJK0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSR3Q9UJK0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSR3Q9UJK0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSR3Q9UJK0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSR3Q9UJK0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSR3Q9UJK0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSR3Q9UJK0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSR3Q9UJK0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSR3Q9UJK0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSR3Q9UJK0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSR3Q9UJK0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSR3Q9UJK0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TSR3Q9UJK0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TSR3Q9UJK0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSR3Q9UJK0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSR3Q9UJK0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSR3Q9UJK0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSR3Q9UJK0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSR3Q9UJK0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSR3Q9UJK0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSR3Q9UJK0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSR3Q9UJK0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSR3Q9UJK0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSR3Q9UJK0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSR3Q9UJK0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSR3Q9UJK0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSR3Q9UJK0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSR3Q9UJK0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSR3Q9UJK0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSR3Q9UJK0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms