Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HACL1Q9UJ83 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HACL1Q9UJ83 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HACL1Q9UJ83 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HACL1Q9UJ83 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HACL1Q9UJ83 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HACL1Q9UJ83 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HACL1Q9UJ83 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HACL1Q9UJ83 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
HACL1Q9UJ83 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
HACL1Q9UJ83 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
HACL1Q9UJ83 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
HACL1Q9UJ83 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
HACL1Q9UJ83 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
HACL1Q9UJ83 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
HACL1Q9UJ83 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
HACL1Q9UJ83 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
HACL1Q9UJ83 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
HACL1Q9UJ83 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
HACL1Q9UJ83 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
HACL1Q9UJ83 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HACL1Q9UJ83 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
HACL1Q9UJ83 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
HACL1Q9UJ83 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
HACL1Q9UJ83 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
HACL1Q9UJ83 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
HACL1Q9UJ83 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
HACL1Q9UJ83 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
HACL1Q9UJ83 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HACL1Q9UJ83 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HACL1Q9UJ83 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HACL1Q9UJ83 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HACL1Q9UJ83 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
HACL1Q9UJ83 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
HACL1Q9UJ83 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
HACL1Q9UJ83 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HACL1Q9UJ83 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HACL1Q9UJ83 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
HACL1Q9UJ83 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
HACL1Q9UJ83 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
HACL1Q9UJ83 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HACL1Q9UJ83 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
HACL1Q9UJ83 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HACL1Q9UJ83 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HACL1Q9UJ83 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HACL1Q9UJ83 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HACL1Q9UJ83 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HACL1Q9UJ83 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HACL1Q9UJ83 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HACL1Q9UJ83 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HACL1Q9UJ83 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HACL1Q9UJ83 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HACL1Q9UJ83 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
HACL1Q9UJ83 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HACL1Q9UJ83 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
HACL1Q9UJ83 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
HACL1Q9UJ83 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
HACL1Q9UJ83 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
HACL1Q9UJ83 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
HACL1Q9UJ83 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
HACL1Q9UJ83 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
HACL1Q9UJ83 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
HACL1Q9UJ83 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
HACL1Q9UJ83 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HACL1Q9UJ83 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HACL1Q9UJ83 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
HACL1Q9UJ83 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
HACL1Q9UJ83 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
HACL1Q9UJ83 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
HACL1Q9UJ83 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
HACL1Q9UJ83 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HACL1Q9UJ83 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
HACL1Q9UJ83 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
HACL1Q9UJ83 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
HACL1Q9UJ83 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
HACL1Q9UJ83 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
HACL1Q9UJ83 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HACL1Q9UJ83 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
HACL1Q9UJ83 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
HACL1Q9UJ83 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
HACL1Q9UJ83 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
HACL1Q9UJ83 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
HACL1Q9UJ83 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
HACL1Q9UJ83 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HACL1Q9UJ83 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
HACL1Q9UJ83 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
HACL1Q9UJ83 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
HACL1Q9UJ83 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
HACL1Q9UJ83 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
HACL1Q9UJ83 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
HACL1Q9UJ83 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
HACL1Q9UJ83 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
HACL1Q9UJ83 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
HACL1Q9UJ83 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
HACL1Q9UJ83 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
HACL1Q9UJ83 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
HACL1Q9UJ83 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
HACL1Q9UJ83 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
HACL1Q9UJ83 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
HACL1Q9UJ83 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms