Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGI6

KCNN3, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN3Q9UGI6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNN3Q9UGI6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNN3Q9UGI6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNN3Q9UGI6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNN3Q9UGI6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNN3Q9UGI6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNN3Q9UGI6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNN3Q9UGI6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNN3Q9UGI6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNN3Q9UGI6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNN3Q9UGI6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNN3Q9UGI6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNN3Q9UGI6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNN3Q9UGI6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNN3Q9UGI6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNN3Q9UGI6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNN3Q9UGI6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNN3Q9UGI6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNN3Q9UGI6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNN3Q9UGI6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNN3Q9UGI6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNN3Q9UGI6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNN3Q9UGI6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNN3Q9UGI6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNN3Q9UGI6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNN3Q9UGI6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNN3Q9UGI6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNN3Q9UGI6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNN3Q9UGI6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNN3Q9UGI6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNN3Q9UGI6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNN3Q9UGI6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNN3Q9UGI6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNN3Q9UGI6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNN3Q9UGI6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNN3Q9UGI6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNN3Q9UGI6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNN3Q9UGI6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNN3Q9UGI6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNN3Q9UGI6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNN3Q9UGI6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNN3Q9UGI6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNN3Q9UGI6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNN3Q9UGI6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
KCNN3Q9UGI6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
KCNN3Q9UGI6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNN3Q9UGI6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNN3Q9UGI6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNN3Q9UGI6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNN3Q9UGI6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNN3Q9UGI6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNN3Q9UGI6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNN3Q9UGI6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNN3Q9UGI6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNN3Q9UGI6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNN3Q9UGI6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNN3Q9UGI6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNN3Q9UGI6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNN3Q9UGI6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNN3Q9UGI6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNN3Q9UGI6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNN3Q9UGI6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNN3Q9UGI6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNN3Q9UGI6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNN3Q9UGI6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNN3Q9UGI6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNN3Q9UGI6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNN3Q9UGI6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNN3Q9UGI6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNN3Q9UGI6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNN3Q9UGI6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNN3Q9UGI6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNN3Q9UGI6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNN3Q9UGI6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNN3Q9UGI6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNN3Q9UGI6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNN3Q9UGI6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNN3Q9UGI6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNN3Q9UGI6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNN3Q9UGI6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNN3Q9UGI6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNN3Q9UGI6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNN3Q9UGI6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNN3Q9UGI6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNN3Q9UGI6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNN3Q9UGI6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNN3Q9UGI6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNN3Q9UGI6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNN3Q9UGI6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNN3Q9UGI6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNN3Q9UGI6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNN3Q9UGI6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNN3Q9UGI6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNN3Q9UGI6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNN3Q9UGI6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNN3Q9UGI6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNN3Q9UGI6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNN3Q9UGI6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNN3Q9UGI6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNN3Q9UGI6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms