Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
IFT172Q9UG01 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
IFT172Q9UG01 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
IFT172Q9UG01 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
IFT172Q9UG01 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC38■■■■□ 3.67
IFT172Q9UG01 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
IFT172Q9UG01 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
IFT172Q9UG01 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
IFT172Q9UG01 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
IFT172Q9UG01 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
IFT172Q9UG01 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
IFT172Q9UG01 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
IFT172Q9UG01 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
IFT172Q9UG01 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
IFT172Q9UG01 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC37.97■■■■□ 3.67
IFT172Q9UG01 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
IFT172Q9UG01 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
IFT172Q9UG01 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
IFT172Q9UG01 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
IFT172Q9UG01 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
IFT172Q9UG01 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
IFT172Q9UG01 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
IFT172Q9UG01 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC37.93■■■■□ 3.66
IFT172Q9UG01 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
IFT172Q9UG01 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
IFT172Q9UG01 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
IFT172Q9UG01 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
IFT172Q9UG01 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
IFT172Q9UG01 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
IFT172Q9UG01 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
IFT172Q9UG01 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
IFT172Q9UG01 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
IFT172Q9UG01 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
IFT172Q9UG01 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
IFT172Q9UG01 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
IFT172Q9UG01 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
IFT172Q9UG01 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
IFT172Q9UG01 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
IFT172Q9UG01 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
IFT172Q9UG01 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
IFT172Q9UG01 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
IFT172Q9UG01 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
IFT172Q9UG01 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
IFT172Q9UG01 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
IFT172Q9UG01 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
IFT172Q9UG01 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
IFT172Q9UG01 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.65
IFT172Q9UG01 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.81■■■■□ 3.64
IFT172Q9UG01 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
IFT172Q9UG01 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
IFT172Q9UG01 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
IFT172Q9UG01 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
IFT172Q9UG01 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
IFT172Q9UG01 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
IFT172Q9UG01 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
IFT172Q9UG01 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
IFT172Q9UG01 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
IFT172Q9UG01 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
IFT172Q9UG01 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
IFT172Q9UG01 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
IFT172Q9UG01 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
IFT172Q9UG01 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
IFT172Q9UG01 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
IFT172Q9UG01 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
IFT172Q9UG01 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
IFT172Q9UG01 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
IFT172Q9UG01 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
IFT172Q9UG01 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
IFT172Q9UG01 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
IFT172Q9UG01 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
IFT172Q9UG01 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
IFT172Q9UG01 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
IFT172Q9UG01 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
IFT172Q9UG01 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
IFT172Q9UG01 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
IFT172Q9UG01 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
IFT172Q9UG01 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
IFT172Q9UG01 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.67■■■■□ 3.62
IFT172Q9UG01 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
IFT172Q9UG01 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
IFT172Q9UG01 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
IFT172Q9UG01 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
IFT172Q9UG01 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
IFT172Q9UG01 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
IFT172Q9UG01 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
IFT172Q9UG01 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
IFT172Q9UG01 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
IFT172Q9UG01 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
IFT172Q9UG01 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
IFT172Q9UG01 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
IFT172Q9UG01 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
IFT172Q9UG01 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
IFT172Q9UG01 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
IFT172Q9UG01 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
IFT172Q9UG01 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
IFT172Q9UG01 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
IFT172Q9UG01 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
IFT172Q9UG01 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
IFT172Q9UG01 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
IFT172Q9UG01 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms