Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NIPSNAP3AQ9UFN0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms