Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPS7AQ9UBW8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPS7AQ9UBW8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPS7AQ9UBW8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPS7AQ9UBW8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPS7AQ9UBW8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPS7AQ9UBW8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COPS7AQ9UBW8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPS7AQ9UBW8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPS7AQ9UBW8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPS7AQ9UBW8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPS7AQ9UBW8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
COPS7AQ9UBW8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPS7AQ9UBW8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPS7AQ9UBW8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPS7AQ9UBW8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPS7AQ9UBW8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPS7AQ9UBW8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPS7AQ9UBW8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPS7AQ9UBW8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPS7AQ9UBW8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPS7AQ9UBW8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPS7AQ9UBW8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPS7AQ9UBW8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPS7AQ9UBW8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPS7AQ9UBW8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPS7AQ9UBW8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPS7AQ9UBW8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPS7AQ9UBW8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPS7AQ9UBW8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPS7AQ9UBW8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COPS7AQ9UBW8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPS7AQ9UBW8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPS7AQ9UBW8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPS7AQ9UBW8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPS7AQ9UBW8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPS7AQ9UBW8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPS7AQ9UBW8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPS7AQ9UBW8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPS7AQ9UBW8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPS7AQ9UBW8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPS7AQ9UBW8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPS7AQ9UBW8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPS7AQ9UBW8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPS7AQ9UBW8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPS7AQ9UBW8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPS7AQ9UBW8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPS7AQ9UBW8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPS7AQ9UBW8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPS7AQ9UBW8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COPS7AQ9UBW8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
COPS7AQ9UBW8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPS7AQ9UBW8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPS7AQ9UBW8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPS7AQ9UBW8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPS7AQ9UBW8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPS7AQ9UBW8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPS7AQ9UBW8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPS7AQ9UBW8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPS7AQ9UBW8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPS7AQ9UBW8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPS7AQ9UBW8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPS7AQ9UBW8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPS7AQ9UBW8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPS7AQ9UBW8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPS7AQ9UBW8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPS7AQ9UBW8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPS7AQ9UBW8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPS7AQ9UBW8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPS7AQ9UBW8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPS7AQ9UBW8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPS7AQ9UBW8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPS7AQ9UBW8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS7AQ9UBW8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS7AQ9UBW8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS7AQ9UBW8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS7AQ9UBW8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS7AQ9UBW8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPS7AQ9UBW8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPS7AQ9UBW8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPS7AQ9UBW8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPS7AQ9UBW8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPS7AQ9UBW8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPS7AQ9UBW8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPS7AQ9UBW8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPS7AQ9UBW8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPS7AQ9UBW8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPS7AQ9UBW8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPS7AQ9UBW8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPS7AQ9UBW8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPS7AQ9UBW8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPS7AQ9UBW8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPS7AQ9UBW8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPS7AQ9UBW8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPS7AQ9UBW8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPS7AQ9UBW8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS7AQ9UBW8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS7AQ9UBW8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS7AQ9UBW8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS7AQ9UBW8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
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