Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR5

CKLF, Chemokine-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKLFQ9UBR5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKLFQ9UBR5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKLFQ9UBR5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKLFQ9UBR5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKLFQ9UBR5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKLFQ9UBR5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CKLFQ9UBR5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKLFQ9UBR5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKLFQ9UBR5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKLFQ9UBR5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKLFQ9UBR5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKLFQ9UBR5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CKLFQ9UBR5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKLFQ9UBR5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKLFQ9UBR5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKLFQ9UBR5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKLFQ9UBR5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKLFQ9UBR5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKLFQ9UBR5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKLFQ9UBR5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKLFQ9UBR5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKLFQ9UBR5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKLFQ9UBR5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKLFQ9UBR5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKLFQ9UBR5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKLFQ9UBR5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKLFQ9UBR5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKLFQ9UBR5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKLFQ9UBR5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKLFQ9UBR5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKLFQ9UBR5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKLFQ9UBR5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKLFQ9UBR5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CKLFQ9UBR5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKLFQ9UBR5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKLFQ9UBR5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKLFQ9UBR5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKLFQ9UBR5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKLFQ9UBR5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKLFQ9UBR5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKLFQ9UBR5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKLFQ9UBR5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKLFQ9UBR5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKLFQ9UBR5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKLFQ9UBR5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKLFQ9UBR5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKLFQ9UBR5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKLFQ9UBR5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKLFQ9UBR5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKLFQ9UBR5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKLFQ9UBR5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKLFQ9UBR5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKLFQ9UBR5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKLFQ9UBR5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKLFQ9UBR5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKLFQ9UBR5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKLFQ9UBR5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKLFQ9UBR5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKLFQ9UBR5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKLFQ9UBR5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKLFQ9UBR5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKLFQ9UBR5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKLFQ9UBR5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKLFQ9UBR5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKLFQ9UBR5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CKLFQ9UBR5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKLFQ9UBR5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKLFQ9UBR5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKLFQ9UBR5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKLFQ9UBR5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKLFQ9UBR5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKLFQ9UBR5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CKLFQ9UBR5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKLFQ9UBR5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKLFQ9UBR5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CKLFQ9UBR5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKLFQ9UBR5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKLFQ9UBR5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKLFQ9UBR5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKLFQ9UBR5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKLFQ9UBR5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKLFQ9UBR5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKLFQ9UBR5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKLFQ9UBR5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKLFQ9UBR5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKLFQ9UBR5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKLFQ9UBR5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKLFQ9UBR5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKLFQ9UBR5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CKLFQ9UBR5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CKLFQ9UBR5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CKLFQ9UBR5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CKLFQ9UBR5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKLFQ9UBR5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKLFQ9UBR5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKLFQ9UBR5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKLFQ9UBR5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKLFQ9UBR5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKLFQ9UBR5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKLFQ9UBR5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms