Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM4

OPTC, Opticin, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTCQ9UBM4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
OPTCQ9UBM4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
OPTCQ9UBM4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
OPTCQ9UBM4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
OPTCQ9UBM4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
OPTCQ9UBM4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
OPTCQ9UBM4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
OPTCQ9UBM4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OPTCQ9UBM4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OPTCQ9UBM4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OPTCQ9UBM4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OPTCQ9UBM4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OPTCQ9UBM4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
OPTCQ9UBM4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OPTCQ9UBM4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OPTCQ9UBM4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
OPTCQ9UBM4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OPTCQ9UBM4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OPTCQ9UBM4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OPTCQ9UBM4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OPTCQ9UBM4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OPTCQ9UBM4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
OPTCQ9UBM4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
OPTCQ9UBM4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OPTCQ9UBM4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OPTCQ9UBM4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
OPTCQ9UBM4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OPTCQ9UBM4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OPTCQ9UBM4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OPTCQ9UBM4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OPTCQ9UBM4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OPTCQ9UBM4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OPTCQ9UBM4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OPTCQ9UBM4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OPTCQ9UBM4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OPTCQ9UBM4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OPTCQ9UBM4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OPTCQ9UBM4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OPTCQ9UBM4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OPTCQ9UBM4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OPTCQ9UBM4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OPTCQ9UBM4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OPTCQ9UBM4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OPTCQ9UBM4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OPTCQ9UBM4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
OPTCQ9UBM4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OPTCQ9UBM4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OPTCQ9UBM4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OPTCQ9UBM4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OPTCQ9UBM4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
OPTCQ9UBM4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OPTCQ9UBM4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OPTCQ9UBM4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OPTCQ9UBM4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OPTCQ9UBM4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OPTCQ9UBM4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OPTCQ9UBM4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OPTCQ9UBM4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OPTCQ9UBM4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OPTCQ9UBM4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
OPTCQ9UBM4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OPTCQ9UBM4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OPTCQ9UBM4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
OPTCQ9UBM4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OPTCQ9UBM4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OPTCQ9UBM4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OPTCQ9UBM4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OPTCQ9UBM4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
OPTCQ9UBM4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OPTCQ9UBM4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OPTCQ9UBM4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OPTCQ9UBM4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OPTCQ9UBM4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OPTCQ9UBM4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OPTCQ9UBM4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OPTCQ9UBM4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OPTCQ9UBM4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OPTCQ9UBM4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OPTCQ9UBM4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OPTCQ9UBM4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
OPTCQ9UBM4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OPTCQ9UBM4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OPTCQ9UBM4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OPTCQ9UBM4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OPTCQ9UBM4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OPTCQ9UBM4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OPTCQ9UBM4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OPTCQ9UBM4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OPTCQ9UBM4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OPTCQ9UBM4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OPTCQ9UBM4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OPTCQ9UBM4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OPTCQ9UBM4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OPTCQ9UBM4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OPTCQ9UBM4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OPTCQ9UBM4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OPTCQ9UBM4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OPTCQ9UBM4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OPTCQ9UBM4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
OPTCQ9UBM4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms