Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZS2

KLRF1, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF1Q9NZS2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLRF1Q9NZS2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLRF1Q9NZS2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLRF1Q9NZS2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLRF1Q9NZS2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLRF1Q9NZS2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLRF1Q9NZS2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KLRF1Q9NZS2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLRF1Q9NZS2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLRF1Q9NZS2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLRF1Q9NZS2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KLRF1Q9NZS2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLRF1Q9NZS2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KLRF1Q9NZS2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLRF1Q9NZS2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLRF1Q9NZS2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLRF1Q9NZS2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLRF1Q9NZS2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLRF1Q9NZS2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLRF1Q9NZS2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLRF1Q9NZS2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLRF1Q9NZS2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLRF1Q9NZS2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLRF1Q9NZS2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLRF1Q9NZS2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLRF1Q9NZS2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLRF1Q9NZS2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLRF1Q9NZS2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLRF1Q9NZS2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLRF1Q9NZS2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KLRF1Q9NZS2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLRF1Q9NZS2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLRF1Q9NZS2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLRF1Q9NZS2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLRF1Q9NZS2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLRF1Q9NZS2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLRF1Q9NZS2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLRF1Q9NZS2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLRF1Q9NZS2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLRF1Q9NZS2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLRF1Q9NZS2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLRF1Q9NZS2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLRF1Q9NZS2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLRF1Q9NZS2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLRF1Q9NZS2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLRF1Q9NZS2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLRF1Q9NZS2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLRF1Q9NZS2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLRF1Q9NZS2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLRF1Q9NZS2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KLRF1Q9NZS2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLRF1Q9NZS2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLRF1Q9NZS2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLRF1Q9NZS2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLRF1Q9NZS2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLRF1Q9NZS2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLRF1Q9NZS2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLRF1Q9NZS2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KLRF1Q9NZS2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLRF1Q9NZS2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLRF1Q9NZS2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLRF1Q9NZS2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLRF1Q9NZS2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLRF1Q9NZS2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLRF1Q9NZS2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLRF1Q9NZS2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLRF1Q9NZS2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLRF1Q9NZS2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLRF1Q9NZS2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLRF1Q9NZS2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLRF1Q9NZS2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KLRF1Q9NZS2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLRF1Q9NZS2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLRF1Q9NZS2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KLRF1Q9NZS2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLRF1Q9NZS2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLRF1Q9NZS2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLRF1Q9NZS2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLRF1Q9NZS2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLRF1Q9NZS2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLRF1Q9NZS2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLRF1Q9NZS2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLRF1Q9NZS2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLRF1Q9NZS2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLRF1Q9NZS2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLRF1Q9NZS2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLRF1Q9NZS2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLRF1Q9NZS2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLRF1Q9NZS2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLRF1Q9NZS2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLRF1Q9NZS2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLRF1Q9NZS2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLRF1Q9NZS2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLRF1Q9NZS2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLRF1Q9NZS2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLRF1Q9NZS2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLRF1Q9NZS2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KLRF1Q9NZS2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLRF1Q9NZS2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLRF1Q9NZS2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms