Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCF3Q9NUQ8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCF3Q9NUQ8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCF3Q9NUQ8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCF3Q9NUQ8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCF3Q9NUQ8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCF3Q9NUQ8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCF3Q9NUQ8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCF3Q9NUQ8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCF3Q9NUQ8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCF3Q9NUQ8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCF3Q9NUQ8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCF3Q9NUQ8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCF3Q9NUQ8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCF3Q9NUQ8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCF3Q9NUQ8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCF3Q9NUQ8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCF3Q9NUQ8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ABCF3Q9NUQ8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCF3Q9NUQ8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCF3Q9NUQ8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCF3Q9NUQ8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCF3Q9NUQ8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCF3Q9NUQ8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCF3Q9NUQ8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCF3Q9NUQ8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCF3Q9NUQ8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCF3Q9NUQ8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCF3Q9NUQ8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCF3Q9NUQ8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCF3Q9NUQ8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCF3Q9NUQ8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCF3Q9NUQ8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCF3Q9NUQ8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCF3Q9NUQ8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCF3Q9NUQ8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCF3Q9NUQ8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCF3Q9NUQ8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCF3Q9NUQ8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCF3Q9NUQ8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCF3Q9NUQ8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCF3Q9NUQ8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCF3Q9NUQ8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCF3Q9NUQ8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCF3Q9NUQ8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCF3Q9NUQ8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCF3Q9NUQ8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCF3Q9NUQ8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCF3Q9NUQ8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCF3Q9NUQ8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCF3Q9NUQ8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCF3Q9NUQ8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCF3Q9NUQ8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCF3Q9NUQ8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCF3Q9NUQ8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCF3Q9NUQ8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCF3Q9NUQ8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCF3Q9NUQ8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCF3Q9NUQ8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCF3Q9NUQ8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCF3Q9NUQ8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCF3Q9NUQ8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCF3Q9NUQ8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCF3Q9NUQ8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCF3Q9NUQ8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCF3Q9NUQ8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCF3Q9NUQ8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCF3Q9NUQ8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCF3Q9NUQ8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCF3Q9NUQ8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCF3Q9NUQ8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCF3Q9NUQ8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCF3Q9NUQ8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCF3Q9NUQ8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCF3Q9NUQ8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCF3Q9NUQ8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCF3Q9NUQ8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCF3Q9NUQ8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCF3Q9NUQ8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCF3Q9NUQ8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCF3Q9NUQ8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCF3Q9NUQ8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCF3Q9NUQ8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCF3Q9NUQ8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCF3Q9NUQ8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCF3Q9NUQ8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCF3Q9NUQ8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCF3Q9NUQ8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCF3Q9NUQ8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCF3Q9NUQ8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCF3Q9NUQ8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCF3Q9NUQ8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCF3Q9NUQ8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCF3Q9NUQ8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCF3Q9NUQ8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCF3Q9NUQ8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCF3Q9NUQ8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCF3Q9NUQ8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCF3Q9NUQ8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCF3Q9NUQ8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms