Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS62

THSD1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD1Q9NS62 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THSD1Q9NS62 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
THSD1Q9NS62 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THSD1Q9NS62 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
THSD1Q9NS62 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THSD1Q9NS62 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THSD1Q9NS62 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THSD1Q9NS62 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THSD1Q9NS62 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THSD1Q9NS62 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
THSD1Q9NS62 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
THSD1Q9NS62 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
THSD1Q9NS62 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
THSD1Q9NS62 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
THSD1Q9NS62 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
THSD1Q9NS62 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
THSD1Q9NS62 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
THSD1Q9NS62 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
THSD1Q9NS62 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
THSD1Q9NS62 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
THSD1Q9NS62 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
THSD1Q9NS62 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
THSD1Q9NS62 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
THSD1Q9NS62 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
THSD1Q9NS62 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
THSD1Q9NS62 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
THSD1Q9NS62 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
THSD1Q9NS62 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
THSD1Q9NS62 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
THSD1Q9NS62 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
THSD1Q9NS62 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
THSD1Q9NS62 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
THSD1Q9NS62 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
THSD1Q9NS62 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
THSD1Q9NS62 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
THSD1Q9NS62 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
THSD1Q9NS62 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
THSD1Q9NS62 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
THSD1Q9NS62 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
THSD1Q9NS62 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
THSD1Q9NS62 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
THSD1Q9NS62 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
THSD1Q9NS62 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
THSD1Q9NS62 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THSD1Q9NS62 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THSD1Q9NS62 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
THSD1Q9NS62 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
THSD1Q9NS62 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
THSD1Q9NS62 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
THSD1Q9NS62 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
THSD1Q9NS62 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
THSD1Q9NS62 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
THSD1Q9NS62 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
THSD1Q9NS62 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
THSD1Q9NS62 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
THSD1Q9NS62 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
THSD1Q9NS62 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
THSD1Q9NS62 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
THSD1Q9NS62 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THSD1Q9NS62 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THSD1Q9NS62 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THSD1Q9NS62 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
THSD1Q9NS62 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THSD1Q9NS62 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
THSD1Q9NS62 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
THSD1Q9NS62 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
THSD1Q9NS62 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
THSD1Q9NS62 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
THSD1Q9NS62 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
THSD1Q9NS62 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
THSD1Q9NS62 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
THSD1Q9NS62 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
THSD1Q9NS62 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
THSD1Q9NS62 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
THSD1Q9NS62 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
THSD1Q9NS62 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
THSD1Q9NS62 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
THSD1Q9NS62 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
THSD1Q9NS62 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
THSD1Q9NS62 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
THSD1Q9NS62 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
THSD1Q9NS62 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
THSD1Q9NS62 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
THSD1Q9NS62 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
THSD1Q9NS62 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THSD1Q9NS62 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THSD1Q9NS62 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THSD1Q9NS62 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THSD1Q9NS62 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
THSD1Q9NS62 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THSD1Q9NS62 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THSD1Q9NS62 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THSD1Q9NS62 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
THSD1Q9NS62 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
THSD1Q9NS62 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THSD1Q9NS62 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
THSD1Q9NS62 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD1Q9NS62 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD1Q9NS62 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THSD1Q9NS62 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms