Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GPHNQ9NQX3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GPHNQ9NQX3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
GPHNQ9NQX3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GPHNQ9NQX3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GPHNQ9NQX3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GPHNQ9NQX3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GPHNQ9NQX3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GPHNQ9NQX3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GPHNQ9NQX3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GPHNQ9NQX3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
GPHNQ9NQX3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GPHNQ9NQX3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GPHNQ9NQX3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GPHNQ9NQX3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GPHNQ9NQX3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GPHNQ9NQX3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GPHNQ9NQX3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GPHNQ9NQX3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GPHNQ9NQX3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GPHNQ9NQX3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GPHNQ9NQX3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GPHNQ9NQX3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
GPHNQ9NQX3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
GPHNQ9NQX3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
GPHNQ9NQX3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GPHNQ9NQX3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GPHNQ9NQX3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GPHNQ9NQX3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GPHNQ9NQX3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GPHNQ9NQX3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GPHNQ9NQX3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GPHNQ9NQX3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GPHNQ9NQX3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GPHNQ9NQX3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GPHNQ9NQX3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
GPHNQ9NQX3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GPHNQ9NQX3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GPHNQ9NQX3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GPHNQ9NQX3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GPHNQ9NQX3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GPHNQ9NQX3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GPHNQ9NQX3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GPHNQ9NQX3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GPHNQ9NQX3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
GPHNQ9NQX3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GPHNQ9NQX3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GPHNQ9NQX3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GPHNQ9NQX3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GPHNQ9NQX3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GPHNQ9NQX3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GPHNQ9NQX3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GPHNQ9NQX3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GPHNQ9NQX3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GPHNQ9NQX3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GPHNQ9NQX3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GPHNQ9NQX3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GPHNQ9NQX3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GPHNQ9NQX3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GPHNQ9NQX3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GPHNQ9NQX3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GPHNQ9NQX3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GPHNQ9NQX3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
GPHNQ9NQX3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GPHNQ9NQX3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GPHNQ9NQX3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GPHNQ9NQX3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GPHNQ9NQX3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GPHNQ9NQX3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
GPHNQ9NQX3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GPHNQ9NQX3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GPHNQ9NQX3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GPHNQ9NQX3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GPHNQ9NQX3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GPHNQ9NQX3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GPHNQ9NQX3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GPHNQ9NQX3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GPHNQ9NQX3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GPHNQ9NQX3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
GPHNQ9NQX3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
GPHNQ9NQX3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GPHNQ9NQX3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GPHNQ9NQX3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GPHNQ9NQX3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GPHNQ9NQX3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GPHNQ9NQX3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GPHNQ9NQX3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GPHNQ9NQX3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GPHNQ9NQX3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GPHNQ9NQX3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GPHNQ9NQX3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GPHNQ9NQX3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GPHNQ9NQX3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GPHNQ9NQX3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GPHNQ9NQX3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GPHNQ9NQX3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GPHNQ9NQX3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GPHNQ9NQX3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GPHNQ9NQX3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GPHNQ9NQX3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms