Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCFQ9NPI8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCFQ9NPI8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCFQ9NPI8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCFQ9NPI8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCFQ9NPI8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCFQ9NPI8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCFQ9NPI8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCFQ9NPI8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCFQ9NPI8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCFQ9NPI8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FANCFQ9NPI8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCFQ9NPI8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCFQ9NPI8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCFQ9NPI8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCFQ9NPI8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCFQ9NPI8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCFQ9NPI8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCFQ9NPI8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCFQ9NPI8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCFQ9NPI8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FANCFQ9NPI8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCFQ9NPI8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCFQ9NPI8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCFQ9NPI8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCFQ9NPI8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCFQ9NPI8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCFQ9NPI8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCFQ9NPI8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCFQ9NPI8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCFQ9NPI8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FANCFQ9NPI8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FANCFQ9NPI8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FANCFQ9NPI8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FANCFQ9NPI8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FANCFQ9NPI8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FANCFQ9NPI8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FANCFQ9NPI8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FANCFQ9NPI8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FANCFQ9NPI8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FANCFQ9NPI8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCFQ9NPI8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCFQ9NPI8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCFQ9NPI8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCFQ9NPI8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCFQ9NPI8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCFQ9NPI8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCFQ9NPI8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCFQ9NPI8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCFQ9NPI8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCFQ9NPI8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCFQ9NPI8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCFQ9NPI8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCFQ9NPI8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCFQ9NPI8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCFQ9NPI8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCFQ9NPI8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCFQ9NPI8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCFQ9NPI8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCFQ9NPI8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCFQ9NPI8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCFQ9NPI8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCFQ9NPI8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCFQ9NPI8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCFQ9NPI8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCFQ9NPI8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCFQ9NPI8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCFQ9NPI8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCFQ9NPI8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCFQ9NPI8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCFQ9NPI8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCFQ9NPI8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCFQ9NPI8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCFQ9NPI8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCFQ9NPI8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCFQ9NPI8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCFQ9NPI8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCFQ9NPI8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCFQ9NPI8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCFQ9NPI8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCFQ9NPI8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCFQ9NPI8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCFQ9NPI8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCFQ9NPI8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCFQ9NPI8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCFQ9NPI8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCFQ9NPI8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCFQ9NPI8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCFQ9NPI8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCFQ9NPI8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCFQ9NPI8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCFQ9NPI8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCFQ9NPI8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCFQ9NPI8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCFQ9NPI8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCFQ9NPI8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCFQ9NPI8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCFQ9NPI8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCFQ9NPI8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCFQ9NPI8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms